На 1 января 2010 г. собрание Хабаровского краевого музея составляло 261937 предметов основного фонда и 143605 предметов научно-вспомогательного фонда. Музейное собрание Гродековского музея представлено следующими коллекциями:
- Археологическая коллекция
- Естественно-научная коллекция
- Этнографическая коллекция
- Историко-бытовая коллекция
- Восточная коллекция
- Изобразительная коллекция
- Фотодокументальная коллекция
- Коллекция негативов
- Коллекция бумажных денежных знаков
- Нумизматическая коллекция
- Филателистическая коллекция
- Коллекция афиш
- Коллекция плакатов
- Коллекция истории техники